Analista - Área: Ciências Biológicas - Subárea: Biologia Avançada e Tecnologia da Informação
Julgue o próximo item, pertinentes ao uso das ferramentas da informática nas pesquisas científicas em biotecnologia.A vantagem do Linux como sistema operacional de escolha para análises bioinformáticas é a disponibilidade de diversos programas executáveis via linha de comando em um terminal de texto. Em um arquivo FASTA (seq.fas) com milhões de sequências, pode-se contar o número único de sequências com o encadeamento dos seguintes comandos de shell BASH no terminal: 'grep ">" seq.fas | sort | uniq | wc -l'.
CCerto
EErrado
Revelar gabarito e comentário▾
GabaritoC — Certo
Comentário gerado por IA. É um apoio ao estudo, ancorado em fontes, mas pode conter imprecisões — confira sempre na fonte oficial (lei, súmula, edital e gabarito da banca). Encontrou um erro? Use “Reportar”.
Comandos Bash: contagem de sequências únicas em FASTA
Gabarito: ✅ CERTO. O encadeamento de comandos grep ">" seq.fas | sort | uniq | wc -l efetivamente conta o número de sequências únicas em um arquivo FASTA, pois:
grep ">" extrai todas as linhas de cabeçalho (que iniciam com ">");
sort ordena essas linhas alfabeticamente;
uniq remove linhas duplicadas consecutivas (após a ordenação, cabeçalhos idênticos ficam adjacentes e são eliminados);
wc -l conta o número de linhas resultantes, que corresponde ao número de sequências distintas.
O uso do pipe (|) permite que a saída de um comando sirva como entrada do próximo, formando um filtro em cadeia. Esse é um padrão comum em análises bioinformáticas no Bash. O comando está correto.
1grep ">" seq.fasExtrai cabeçalhos
2sortOrdena alfabeticamente
3uniqRemove duplicatas consecutivas
4wc -lConta linhas resultantes
LEVEL · soulevel.com.br
PEGA ESSA DICA!
Em arquivos FASTA, cada sequência tem um cabeçalho iniciado por ">". Para contar sequências, basta contar essas linhas. O uniq só funciona corretamente se as duplicatas estiverem consecutivas, por isso o sort é essencial antes. Esse pipeline é eficiente mesmo para milhões de sequências.