Questão de Veterinária — Genética em Medicina Veterinária — CESPE / CEBRASPE 2025

Ciências ômicas e sequenciamento de nova geração

Gabarito: ❌ ERRADO. O item está incorreto porque a tecnologia Illumina, embora seja um sequenciamento de nova geração (NGS) amplamente utilizado, produz leituras curtas (short reads) que, isoladamente, não permitem a montagem completa de genomas em uma única sequência contígua (contig único) — especialmente em procariotos, cujos genomas podem conter regiões repetitivas que dificultam a montagem. A montagem completa em um único contig (genoma fechado) geralmente requer a combinação de diferentes tecnologias, como sequenciamento de leituras longas (ex.: PacBio, Oxford Nanopore) ou estratégias de scaffolding.

O sequenciamento de nova geração (NGS) revolucionou a genômica ao permitir o sequenciamento em massa de fragmentos de DNA de forma paralela e com custo reduzido. A tecnologia Illumina, uma das plataformas NGS mais difundidas, baseia-se na síntese de DNA por terminadores reversíveis, gerando milhões de leituras curtas (geralmente de 50 a 300 pares de bases). Essas leituras curtas são então alinhadas a um genoma de referência ou montadas de novo (de novo assembly) por meio de algoritmos que buscam sobreposições entre as sequências.

O principal desafio da montagem de genomas com leituras curtas é a presença de regiões repetitivas, que podem ser maiores que o comprimento das leituras, criando ambiguidades na montagem. Em procariotos, embora os genomas sejam relativamente pequenos (em média 2 a 10 Mb), eles também contêm elementos repetitivos, como sequências de inserção, rRNA e transposons, que podem impedir a montagem em um único contig. Por isso, a afirmação de que a tecnologia Illumina oferece resolução para a montagem completa em uma única sequência contígua é incorreta.

Para obter um genoma completo e fechado (sem gaps), as abordagens modernas frequentemente combinam leituras curtas (para alta precisão) com leituras longas (para atravessar regiões repetitivas) ou utilizam técnicas de scaffolding com mapas ópticos ou Hi-C. Assim, a montagem em um único contig é possível, mas não é uma característica intrínseca da tecnologia Illumina isoladamente.

A pegadinha da questão está em atribuir à Illumina uma capacidade que ela não possui sozinha: a montagem completa em um único contig. O candidato pode ser induzido a pensar que, por ser uma tecnologia moderna e amplamente usada, ela seria suficiente para fechar genomas, mas a realidade técnica é diferente. Além disso, o item menciona "revelar um amplo potencial de possíveis bioprodutos", o que é verdadeiro no sentido de que a genômica pode identificar genes de interesse biotecnológico, mas isso não torna a afirmação correta, pois o erro central está na montagem.

Portanto, o item é ERRADO porque a tecnologia Illumina, com suas leituras curtas, não oferece, por si só, resolução para a montagem completa de genomas em uma única sequência contígua.

Item — ❌ Errado

O item afirma que a tecnologia Illumina, com leituras curtas, oferece resolução para a montagem completa de genomas em uma única sequência contígua. Isso é falso. As leituras curtas da Illumina (50-300 pb) são insuficientes para resolver regiões repetitivas, que são comuns mesmo em genomas procarióticos. A montagem completa em um único contig (genoma fechado) requer, na prática, a combinação com leituras longas ou outras técnicas de scaffolding. O erro é técnico e conceitual: a plataforma Illumina é excelente para re-sequenciamento e montagem de genomas em nível de contigs, mas não garante a montagem completa em uma única sequência contígua.

Gabarito: ❌ ERRADO.